在申请地理标志的过程中，申请人可能会遇到各种问题和挑战。以下是一些常见的问题：

1. 资格确认：确定谁有资格申请地理标志，通常是生产者团体、行业协会或政府机构。明确地理标志是否适用于个人或私营企业，还是仅限于非营利组织或公共机构。
2. 文档准备：准备完整的申请材料，包括证明产品与地理区域之间的联系、产品的历史、传统生产方法、地理环境影响等证据。编写详细的使用管理规则，明确地理标志的使用条件、监控机制和违规处罚等。
3. 证明材料的收集：收集足够的证据证明地理标志商品的存在和声誉，如历史文献、官方记录、科学数据等。需要获得当地政府或行业主管部门的授权文件，确认申请人的资格和地理标志的合法性。
4. 分类与申请：确定产品在《商标注册用商品和服务国际分类表》中的正确分类。如果申请人已经在同一种或类似商品上注册了普通商标，可能需要处理潜在的冲突或选择放弃原有商标。
5. 审查与反馈：等待官方审查期间，可能会收到关于申请材料的补充要求或修改建议。处理审查机构提出的任何异议或反对意见，可能需要进行答辩或调解。
6. 使用与监管：制定和执行地理标志的使用规则，确保所有使用者遵守标准。监督地理标志的使用，防止滥用或误导消费者，可能需要设立专门的监管机构或委员会。
7. 市场认知：如何提升消费者对地理标志的认知和理解，教育市场关于地理标志的意义和价值。建立地理标志产品的品牌，增强其市场竞争力和消费者信任。
8. 国际注册与保护：如果产品计划出口，了解国际地理标志保护体系，如马德里协定或里斯本协定。在多个国家或地区注册地理标志，以获得广泛的保护。
9. 法律与合规：确保地理标志的申请和使用符合国内和国际的法律法规。应对可能出现的法律纠纷，如侵权、假冒等问题。

10.资源与资金：确保有足够的资源和资金来完成整个申请过程，包括律师费、官方费用和维护费用。

这些问题需要申请人做好充分的准备，可能需要寻求专业顾问的帮助，如知识产权律师或地理标志注册专家，以确保申请过程顺利进行。此外，了解并遵守相关法律法规，以及与政府机构、行业协会和潜在的地理标志使用者保持良好的沟通也非常重要。